یک گودزیلای سوزان که در آستانه فروپاشی و انفجار است، برای محاصره هنگ‌کنگ ظاهر می‌شود. هم‌زمان، موجودات هولناک جدیدی در ژاپن کشف می‌شوند. به نظر می‌رسد این موجودات سخت‌پوست‌مانند، از ناوشکن اکسیژن متولد شده‌اند؛ همان سلاحی که گودزیلای اصلی را از بین برد.

دندان عقل؛ در زبان ژاپنی به معنای «والدینم را نمی‌شناسم» است. برخلاف دندان درآوردن نوزاد، والدین هرگز از شروع رشد این دندان باخبر نمی‌شوند. یک روز، دانش‌آموز دبیرستانی به نام آسومی که دندان عقلش را کشیده است، متوجه وجود دنیای جدیدی می‌شود.

وقتی خانواده یورا از توکیو به حومه شهر نقل مکان می‌کنند، او وارد یک مدرسه مسیحی می‌شود؛ مذهبی که هیچ چیز درباره آن نمی‌داند. یورا در تلاش است تا ساختار مدرسه و رفتار دانش‌آموزان را درک کند که ناگهان یک عیسی مینیاتوری وارد زندگی‌اش می‌شود.